1、净化的水分子不同
　　纳滤膜：百截留有机物的分子量大约为150-500左右，截留溶解性盐的能力为2-98%之间，对单价阴离子盐溶液的脱盐低于高价阴离子盐溶液。
　　RO膜：可阻挡所有溶解的无机分子度以及任何相对分子质量大于100的有机物，水分子可通过薄膜成为纯水，对水中二价离子的脱除率可达99.5%，对一价离子的脱除率也在95%以上。

2、应用范围不同
　　纳滤膜：可应用于水质的软化、降低TDS浓度、去除色度和有机物，它的大部分应用领域是饮用水的答软化和有机物的脱除。
　　RO膜：广泛应用于太空水、纯净水、超纯回水的制备；化工工艺中水的浓缩、分离、提纯及纯水制备；海水、苦咸水淡化；造纸、电镀、印染等行业用水、中水及工业废水的回用。
　　3、工作原理不同
　　纳滤膜：纳滤是在压力差推动力作用下，盐及小分子物质透过纳滤膜而截留大分子物质，介于超滤和反渗透之答间。
　　RO膜：采用反渗透方式，以压力差为推动力，从溶液中分离出溶剂。